Neste jogo, Kratos - o herói espartano da primeira saga - já se encontra no Olimpo após destronar Ares e inicia sua jornada como deus da guerra.No entanto, por sua descendência mortal, não é bem visto pelos outros deuses que, após suas demasiadas intervenções em favor de Esparta em Guerras, é avisado por Atena de que deve parar ou será combatida. Não aceitando os avisos, Kratos arrisca-se em mais uma guerra pelos espartanos e é atacado pelo Colosso de Rodes que está sendo controlado por interferência do deuses. Durante a luta, Zeus lhe envia uma espada a Blade of Olympus(Lamina do Olímpo) que drena os poderes divinos de Kratos, fazendo com que Kratos se torne novamente mortal. Pois Zeus estava furioso com Kratos por esse ter insultado os deuses do olimpo constantemente e agir de forma caotica com os seu guerreiros espartanos contra cidades da grecia que veneram outros deuses do olimpo.Dessa forma, o Rei dos deuses revela ser o inimigo a quem Kratos esteve combatendo, afirmando que este não se tornará uma ameaça para o Olimpo e ferindo mortalmente Kratos, que é enviado para o Tártaro.No caminho, Kratos encontra a Titã Gaia (Mãe Terra) que lhe cura a ferida feita por Zeus e o acorda para que retorne à superfície.Ao retornar, Kratos tem sede de vingança e agora deverá retornar ao Olimpo e destruir Zeus. Para tal feito, Kratos deve seguir até a ilha da criação e alcançar as Moiras, três irmãs que controlam o destino de todos seres vivos, inclusive dos deuses. Sua missão é retornar ao exato momento em que é derrotado por Zeus e assim mudar seu destino.No caminho dessa longa saga muito sobre o passado de Zeus e do Olimpo é revelado. E para cumprir sua missão Kratos passará a contar com novos aliados, os Titãs, entre eles Atlas, Gaia, Cronos e Tifão (mesmo contra a vontade deste último). Kratos também encontrará outros personagens da mitologia grega, dos quais alguns o espartano vai adquirir alguns poderes e itens essenciais para dar continuidade na sua jornada, como Prometeu, Teseu, Perseu, Pegasus, Ícaro e Euryale, irmã de Medusa.Então, cumprindo a missão que Gaia enviou, ele busca o portal do destino, que era controlado por Cloto, mudando seu destino e ferindo quase mortalmente Zeus como a Blade of Olympus que recuperou durante a batalha. Numa tentativa de golpe mortal em Zeus, acerta Atena, ferindo-a gravemente, mas antes de morrer Atena revela a Kratos que Zeus é seu pai e diz que os Deuses numca aceitaria sua vigança e protegeriam Zeus então ela morre.Kratos se levanta e diz "Se todo o Olímpo não aceita minha vigança então todo o Olímpo irá morrer, eu tenho vivido na sombra dos Deuses por muito tempo o tempo dos Deuses está indo para o fim".Depois Kratos volta no tempo para a Guerra dos Titãs, ele conversa com Gaia dizendo a ela que Zeus está fraco, Ares e Atena estão mortos e que ele possui a espada (Blade of Olympus), e diz que eles podem ganhar está guerra mais não neste tempo, levando Gaia e todos Tiãs para o futuro.Enquato isso Zeus depois de ter fugido da luta com Kratos, vai para o Monte Olímpo e chama alguns deuses(Poseidon, Hades, Hélios e Hermes)para uma reunião, dizedo que eles tem que esquecer suas brigas e diferenças e lutar contra essa besta(Kratos)fazendo o Olímpo prevalecer.No momento da reunião o Monte Olímpo começa a tremer, os deuses vão corredo para ver o que é, e quando olham vem os Titãs subindo o Monte Olímpo, liderados por Kratos que estar em cima da Gaia segurando a Blade of Olympus e diz "Zeus o seu filho voltou e eu trouxe a detruição de todo o Olímpo".Depois a frase "The end Begins..."(O fim Começa...)aparece na tela dando uma vontade de saber o final da história. Queria muito que tivessse God of War 3 para ps2 neh, para saber o fim de tudo.